В 1994 году избран депутатом Законодательного собрания Кубани, через год — депутатом Государственной думы второго созыва. В 1999 году переизбран в Госдуму от КПРФ.
3 декабря 2000 года был выбран губернатором Кубани (переизбран в 2004, переназначен в 2007 и 2012гг.).
В апреле 2015 года Александр Ткачев, с 2001 года руководивший Краснодарским краем, был назначен главой Минсельхоза. По итогам 2017 года среди российских министров он оказался на втором месте по доходам (548,25 млн рублей) и на первом — по темпам их роста (почти в 98 раз).При этом в 2016 году Ткачев стал самым «бедным» министром, задекларировав всего 5,6 млн рублей.
7 мая 2018 года премьер Дмитрий Медведев подписал распоряжение о сложении полномочий кабинетом министров. Это произошло после вступления в должность Владимира Путина, который в этот же день официально в четвертый раз стал президентом страны. В новый состав правительства Александр Ткачев не вошел.
На должность министра сельского хозяйства президент России Владимир Путин предложил назначить председателя правления Россельхозбанка Дмитрия Патрушев — сына секретаря Совета безопасности Николая Патрушева.
Источники РБК Краснодар и РБК Ростов заявляли, что после отставки Александр Ткачев может занять должность полномочного представителя президента в Южном Федеральном округе. Однако 26 июня президент России Владимир Путин подписал указ о переназначении действующего полномочного представителя Владимира Устинова.
По информации ряда СМИ, Александр Ткачев мог стать новым послом России в Белоруссии, однако 27 июня РБК сообщил, что на эту должность рассматривают Михаила Бабича.Также, по данным источников, изучались варианты назначения его полпредом президента в Приволжском федеральном округе.
Когда Ткачев занимал государственные должности, многократно поднимался вопрос конфликта интересов. Так, в начале 2016 году проблему озвучил зампредседателя антикоррупционного комитета Госдумы Александр Хинштейн, так как близкие родственники Ткачева владеют крупными российскими предприятиями, занимающимися сельским хозяйством.
Выселковский «Агрокомплекс» основан в Краснодарском крае в 1993 году отцом нынешнего министра сельского хозяйства РФ Николаем Ткачевым. Холдинг объединяет более 60 компаний, которые занимаются животноводством, растениеводством, птицеводством, производством кормов, мясопереработкой, хранением и логистикой.
По словам Александра Ткачева, бенефициарами компании являются члены его семьи. Холдинг активно прирастает год от года, выходя в число лидеров РФ по различным параметрам. В частности, за 2016 год он увеличил земельный банк на 40% до 640 тыс. га. Это позволило выселковскому агрохолдингу занять четвертое место в рейтинге крупнейших владельцев сельхозземель.
Кроме этого, он является крупнейшим в РФ производителем молока, а также входит в топ-5 производителей риса. Кроме того, в сентябре 2017 года «Агрокомплекс» занял третье место в России по площади земель в обработке — 460 тыс. га.
В ближайшее время «Агрокомплекс им. Ткачева» может войти в топ-3 лидеров РФ по производству мяса птицы — компания рассматривает возможность приобретения агрохолдинга «Белая птица» (Курск).
Выручка компании в 2015 году достигла 38,6 млрд руб., увеличилась до 44,7 млрд руб. в 2016 году и составила 44,6 млрд руб. по итогам прошлого года. В то же самое время, чистая прибыль сократилась — с 6,6 млрд руб. в 2015 году до 2,9 млрд руб. в 2016 году, а в 2017 сменилась убытком в 2,11 млрд рублей.